Khi tin tức đầu tiền về sự kiện Trận đồn Sumter lan truyền đến vùng Cincinnati, Lucy đã có thái độ ủng hộ đối với cuộc chiến này. Bà cảm thấy rằng nếu bà có mặt tại đồn quân sự Sumter với đơn vị quân sự là những người phụ nữ thì có lẽ họ đã không đầu hàng. Sự nhiệt tình của bà đã khuyến khích Rutherford nhập ngũ với tư cách là thiếu tá trong Đội quân tình nguyện số 23 của bang Ohio.[1] Và bà cũng thường xuyên - đôi khi cùng mẹ và các con, đến thăm chồng mình. Bà cũng hỗ trợ anh mình là bác sĩ Joe Webb để chăm sóc những người bệnh.[3]

Vào tháng 9 năm 1862, Rutherford bị thương trong trận chiến ở Middleton, Maryland. Tuy nhiên do sự nhầm lẫn về giấy tờ nên bà nghĩ rằng ông nhập viện ở Washington nên Lucy đã tức tốc đến thủ đô của Hoa Kỳ để hỗ trợ ông. Cuối cùng, bà cũng tìm được chồng mình tại Maryland và sau hai tuần dưỡng bệnh, cả hai đã quay trở lại bang Ohio bằng xe lửa cùng với những binh lính bị thương khác.[4]

Sau khi Rutherford trở lại làm việc tại trung đoàn của mình, Lucy đã thường xuyên đến trại quân đội của ông.[4] Bà hỗ trợ những người bị thương, cổ vũ tinh thần cũng như an ủi những người lính đang nằm xuống.[5] Bà luôn đảm bảo cho sự tiếp tế của những người dân miền Bắc với quân đội Liên minh.[6] Lucy cũng thường tham gia cùng mẹ mình tại các trại quân đội và anh trai Joe của bà cũng là bác sĩ phẫu thuật của trung đoàn.[4] Những người lính tại Lực lượng Bộ binh Tình nguyện bang Ohio số 23 đã đặt cho bà một biệt danh trìu mến là "Mẹ Lucy" vì sự hỗ trợ cũng như phục vụ tận tình của bà.[5] Cựu Tổng thống Hoa Kỳ William McKinley lúc hai mươi tuổi, đã từng dành hàng giờ của mình để đốt lửa trại vì Lucy đang ngồi gần đó.[4]

Joe, đứa con sơ sinh của cả hai đã không may mắn qua đời trong khi cả gia đình đang tập trung tại một trại quân đội.[4]